Gleichzeitig mit Miitomo startet im März 2016 das neue Bonusprogramm "My Nintendo" als Club-Nintendo-Nachfolger. Hierzu schreibt Nintendo Deutschland ziemlich kryptisch: "My Nintendo will aber mehr bieten als ein herkömmliches Belohnungsprogramm. Es ist vielmehr ein umfassender Service, der es auf vielfältige Weise honoriert, wenn man Produkte oder Dienstleistungen von Nintendo nutzt." Deutlich besser präsentiert wurde das Bonussystem im Rahmen einer Investorenversammlung .

Das punktebasierte Bonussystem wird als Brücke zwischen mobilen bzw. "smarten" Geräten und dedizierten Videospielsystemen (3DS, Wii U) verstanden. Es wird zwei Arten von Punkten geben: Platin und Gold. Platin-Punkte gibt es für die Nutzung bestimmter Apps auf "smarten" Geräten (nicht auf 3DS oder Wii U), wenn man sich in den Nintendo eShop einloggt oder irgendwelche anderen Kriterien erfüllt werden. Gold-Punkte wird es als "Belohnung" für digitale Käufe von Wii-U- oder 3DS-Spielen geben. Im Gegensatz zum Club Nintendo soll es mehr Möglichkeiten geben, diese Punkte zu erlangen. Platin-Punkte wird man gegen nicht näher benannte (exklusive) digitale Inhalte eintauschen können. Für Gold-Punkte wird man Rabatt-Gutscheine für digitale Käufe (3DS, Wii U) bekommen können. Der Service soll in Zukunft weiter ausgebaut werden (Cloud-Speicherung, Freundschaftssystem etc.). Nintendos erstes Ziel für My Nintendo sind 100 Millionen Nutzer.

My Nintendo wird ab März in folgenden Ländern verfügbar sein: Großbritannien, Irland, Frankreich, Belgien, Deutschland, Österreich, Schweiz, Polen, Bulgarien, Kroatien, Tschechien, Zypern, Luxemburg, Spanien, Portugal, Italien, Niederlande, Dänemark, Norwegen, Finnland, Malta, Griechenland, Schweden, Estland, Ungarn, Slowenien, Slowakei, Rumänien, Litauen, Lettland, Russland, Südafrika, Australien, Neuseeland, Japan, den USA, Kanada, Mexiko und Brasilien.