Laut einem Bericht von 1up wird Metroid Prime Hunters entgegen früheren Ankündigungen doch keinen Online-Modus enthalten - im Gegensatz zu anderen Spiele wie Mario Kart DS. Der Grund dafür liegt in der drohenden Verspätung des Games, die Nintendo nicht riskieren will - immerhin wird der Wi-Fi-Modus für vier Kopfgeldjäger nicht wegrationalisiert.