Am 6. Juli 2016 startet bei Star Trek Online (ab 12,50€ bei kaufen) (Free-to-play) die dritte Erweiterung "Agents of Yesterday". Zum 50. Jubiläum von Star Trek: Raumschiff Enterprise führt Agents of Yesterday die Spieler in der Zeit zurück, um als Captain das Kommando über ein Schiff aus der Ära zu führen, "in der alles begann. In dieser Erweiterung kommen alle Zeitlinien und Universen aus Star Trek zusammen. Die Spieler werden auf eine Mission in die Vergangenheit geschickt, um als Zeitagenten die Zukunft zu retten. Zusätzlich gibt es (...) über ein Dutzend neue Raumschiffe und mehrere neue besondere Episoden, in denen (...) Figuren aus unterschiedlichen Star-Trek-Serien auftreten, unter anderem Chekov (Walter Koenig), Scotty (Chris Doohan), Admiral Leeta (Chase Masterson) und Agent Daniels (Matt Winston)."