Für Halcyon 6: Starbase Commander steht das große Update v1.1 "Combat & Customization" bereit (Change-Log ). Basierend auf dem Feedback der Spieler wollen die Entwickler (Massive Damage) die Kämpfe verbessert und abwechslungsreicher gestaltet haben. Weniger Grind und mehr Herausforderungen sowie Vielfalt werden versprochen, vor allem in der zweiten Hälfte des Spiels. Außerdem können die Raumschiffe der Erdlinge nun komplett angepasst werden. Mit der neuen "Officer Cloning Chamber" können tote Offiziere wieder zurückgebracht werden - mit leichten Abstrichen.